Anthropic은 수요일 Claude가 박테리오파지 DNA에서 지금까지 규명되지 않은 효소 시스템을 스스로 찾아냈다고 밝혔다. 회사는 이 발견을 사내 생명과학 연구 조직과 실험실 공개에 맞춰 프리프린트로 내놓는다.
핵심 요약
- Claude 에이전트 약 950개가 21시간 동안 토큰 2억 1,000만 개를 써서 DNA 서열 데이터베이스를 훑었다. 역전사효소 20만 개 이상을 모아 후보 시스템 3,500개로 좁힌 뒤 최종 보고서 20건을 남겼다.
- 한 에이전트가 특이한 역전사효소 옆에 놓인 탠덤 반복 배열을 짚어냈다. CRISPR를 연상시키는 구조로, Anthropic은 이를 배열 연관 역전사효소(ART)라고 부른다.
- 프리프린트를 검토한 CRISPR 선구자 펑 장은 RNA 반복 배열이 실제로 흥미롭다며 추가 연구할 가치가 있다고 평가했다.
Claude가 실제로 찾아낸 것
역전사효소는 RNA를 다시 DNA로 복사한다. 최근 몇 년 사이 수백 개 계통이 목록에 올랐고 대부분은 세균에서 나왔다. 세균에서 이 효소들은 미생물 면역계의 일부를 이룬다. 거의 전부가 유전체 마이닝으로 발견됐다. 서열 데이터베이스에서 정체가 밝혀지지 않은 유전자를 뒤지고, 이상한 것을 알아보고, 무슨 일을 하는지 알아내는 방식이다.
이번 시스템의 중심에 있는 역전사효소는 점보 파지에서 나왔고 앞선 연구들에 이미 기술돼 있었다. 아무도 기록하지 않았던 것은 그 이웃이다. 일정한 간격으로 늘어선 비암호화 DNA 반복 배열과 기능을 알 수 없는 보조 단백질이 옆에 있었다. 이 세 부분을 합치면 ART는 지금까지 극소수 시스템에서만 확인된 특징 조합을 갖는데, 그 시스템들은 모두 프로그래밍이 가능하고 DNA를 자르거나 복사하거나 붙일 수 있다. Anthropic의 첫 실험에서 ART 배열은 서로 구별되는 짧은 RNA들로 전사됐다. CRISPR 배열이 CRISPR-Cas 도구의 표적을 지정하는 가이드 서열을 공급하는 방식과 같다.
ART의 기능은 여전히 알려지지 않았고, 회사도 이를 분명히 한다. 후속 실험이 진행 중이다.
탐색은 어떻게 진행됐나
사람의 지시는 프롬프트에서 멈췄다. 과학자들은 Claude에게 대규모 DNA 서열 데이터베이스에서 흥미로운 새 역전사효소 사례를 찾아보라고 요청했다. 그 뒤로는 에이전트가 어떤 계통을 조사할지, 어떤 후보가 보고서를 쓸 만한지 직접 골랐다. Anthropic에 따르면 이 작업에는 에이전트 약 950개와 토큰 2억 1,000만 개가 21시간 동안 투입됐고, 같은 분석을 전문가가 하면 수 주에서 수 개월이 걸린다.
발견의 순간은 에이전트 자신의 기록에 남아 있는데, 파이프라인 로그라기보다 대학원생의 메모처럼 읽힌다. 에이전트는 해당 서열을 두고 굉장하다고 적었고 탠덤 반복 배열이 눈에 보인다고 썼다. 이어 반복 단위를 세고 간격을 측정했으며, 알려진 역전사효소 시스템과 구조를 비교하고 선행 보고가 있는지 문헌을 검색한 뒤 사람이 검토할 보고서를 제출했다.
그 검토가 속도 조절 장치다. Claude는 관련 논문을 읽고, 공개 데이터로 기존 결과를 재현해 자기 방법을 점검하며, 후보마다 근거와 함께 기능을 제안한 다음 그 근거를 다시 비판적으로 들여다본다. 후보 대부분이 탈락하는 단계가 바로 여기다. 한 차례 조사가 시험해 볼 만한 후보 하나로 끝날 수도 있고, 아예 하나도 남지 않을 수도 있다. 실험은 전적으로 사람 과학자가 베이 에어리어 시설에서 수행한다. 이 시설은 BSL-1과 BSL-2 수준 작업으로 제한되며 인체 병원체는 다루지 않는다고 회사는 이달 초 확인했다.
이것이 중요한 이유
가설을 만드는 일이 충분히 싸지면서 Anthropic은 이제 가설 자체를 연구 대상으로 삼는다. 시험해 볼 가치가 있는 제안과 자사 과학자들이 버리는 제안을 무엇이 갈라놓는지 묻고, 그 답을 다시 Claude의 지시문에 반영한다. 이는 "AI가 발견을 해냈다"는 주장과는 다른 이야기다. 희소한 자원이 후보를 만들어내는 쪽에서 후보를 걸러내는 쪽으로 옮겨갔다는 뜻이다.
Anthropic의 발표문에 실린 장 교수의 평가는 절제돼 있다. 흥미롭고 살펴볼 만하다는 것이지, 새 유전자 편집 도구가 나왔다는 말이 아니다. ART가 프로그래밍 가능한지는 토큰 예산이 아니라 실험실에서 판가름 날 경험적 질문이다. Anthropic은 외부 연구자들이 유전체학을 비롯한 여러 분야의 문제를 가지고 오기를 바란다고 밝혔다.
FAQ — 자주 묻는 질문
ART는 CRISPR 같은 새 유전자 편집 도구인가
아직 아니고, 끝내 아닐 수도 있다. ART는 효소와 짧은 RNA로 발현되는 DNA 반복 배열이 짝을 이루는 구조를 CRISPR와 공유하지만, 생물학적 기능은 아직 규명되지 않았다. Anthropic은 작동 방식을 알아내기 위한 실험이 계속되고 있다고 밝혔다.
실험도 Claude가 했나
아니다. 실험대 작업은 모두 Anthropic의 베이 에어리어 실험실에서 사람 과학자가 수행한다. Claude는 데이터베이스 검색, 후보 선별, 보고서 작성을 맡았고 이후 실험 데이터 해석을 돕는다.
원 연구는 어디서 볼 수 있나
Anthropic은 ART 시스템을 더 자세히 다룬 프리프린트와 기술 보고서를 공개했고, 둘 다 발표문에서 링크된다. 회사는 이 결과가 초기 단계라고 설명하며 시스템의 기능이 밝혀지기 전에 먼저 공유한다고 밝혔다.
